При использовании Полных прав при оперативном проведении остатки по складу (а тем более свободный остаток) не контролируется.

Однако при списании товара в минус, конечно, появится легендарное сообщение:

Управленческий учет. Документ Требование-накладная 00000000171 от 03.15.2012 12:00:01, табличная часть «Товары»
Не списано по партиям 1 шт товара …, со склада: Основной склад

Также (в типовых ролях) использование Журнала регистрации доступно только для Полных прав.